او که کار خود را در سینما به عنوان کارگردان آغاز کرد در سال های نخست کار خود پیش از آن که سراغ ساخت فیلم سینمایی برود، فیلم کوتاه می ساخت. او تحصیلات خود را در مرکز اسلامی آموزش فیلمسازی دنبال کرد. او نخستین فیلم سینمایی خود را با عنوان «آفتاب و عشق» در سال ۱۳۶۸ ساخت و «بر بال فرشتگان» و «توفان شن» دیگر فیلم های سینمایی او هستند. شمقدری خود فیلمنامه این فیلم ها را هم نوشته است. شمقدری همچنین سریال «نفوذ» را هم کارگردانی کرده است.
او غیر از کارگردان در مقام مدیریت محراب فیلم هم حضور داشت و همچنین عضویت در شورای فیلمنامه حوزه هنری، سیما فیلم، مرکز سینمای تجربی و انجمن سینماي دفاع مقدس از دیگر فعالیت های اوست.
او پیش از آنکه در مقام معاون امور سینمایی در وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی مشغول شود، به عنوان مشاور هنری رئیس جمهور در دولت اول محمود احمدی نژاد فعالیت داشت.
در دوره مدیریت جواد شمقدری معاونت امور سینمایی با تغییراتی در ساختار تبدیل به سازمان سینمایی شد.